gtf文件获得基因长度报错

老师,您好,我在做转录组分析的时候,利用get_gene_length_from_gtf.py脚本获得基因长度的时候报错,如下图:attachments-2022-12-A5ogmoZn638cba3e49e26.png

而我的gtf文件如下图:

attachments-2022-12-3y4nTBBa638cba646ee7c.png不知道什么原因,生成gene.bed文件时时正常的,谢谢!

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

检查一下gft文件里面有一行,没有gene_id信息

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