老师您好！我想问下当我在计算群体间遗传分化指数（Fst）时,发现其中两个品种间的Fst值很大，但是群体结构分析中（PCA，NJ-Tree,最大似然树）中却发现这两个品种聚类较近，且在一个分支上。这应该怎么解释啊？谢谢老师！ - 组学大讲堂问答社区

老师您好！我想问下当我在计算群体间遗传分化指数（Fst）时,发现其中两个品种间的Fst值很大，但是群体结构分析中（PCA，NJ-Tree,最大似然树）中却发现这两个品种聚类较近，且在一个分支上。这应该怎么解释啊？谢谢老师！

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分类：重测序

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2 个回答

omicsgene - 生物信息 2022-12-28 11:19

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

fst需要计算群体间的每个群体建议最少10个个体以上，你两个样本没法计算，

 2022-12-28 21:29

我的样本量是每个品种(群体)10个个体（公母各半），不是两个样本计算的。

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 提出于 2022-12-28 03:19