用tassel进行vcf和hapmap格式转换时，在对vcf文件排序时报错： Chromosome: name can't be null or empty。可是染色体都有名字呀，不知道哪里有问题，希望有懂的大神帮忙回答一下 - 组学大讲堂问答社区

用tassel进行vcf和hapmap格式转换时，在对vcf文件排序时报错： Chromosome: name can't be null or empty。可是染色体都有名字呀，不知道哪里有问题，希望有懂的大神帮忙回答一下

在此之前已经通过grep -v -E "^##|^Contig"过滤掉以##和Contig开头的行了，染色体名字也从LG01转变成1了

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omicsgene - 生物信息 2023-03-03 09:11

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

## 双井好的行一般不过滤，有些软件会读取这些信息

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梁家姑娘提出于 2023-03-02 10:53