100 注释最终的结果不理想 不知道从哪里下手改进流程

attachments-2023-03-6Fim9dbX642101a47d3ed.jpg

补充描述及问题

1.组装软件尝试过wtdbg2(n50:26MB、LAI:7.41)、canu(n50:24MB、LAI:8.77),还没有尝试过quickmerge合并基因组,但这三个版本LAI最高也就8.81,合并后会比最高的高吗?

2.这是一个植物基因组,重复序列中unknow比例有30%,使用deepte后能降到20%,但80%重复序列加20%unknow是不是高的不太正常?

3.完成基因注释后的结果并不理想,我应该从组装开始尝试修改还是先尝试evm进行注释看看?

请先 登录 后评论