5 barcode和引物的fa文件

你好!

在pacbio 三代全长转录组数据分析流程 Iso-Seq 3中,第二步测序引物和barcode的去除中,barcode和引物是每个样本特定的,还是全长转录组-pacbio共有的?

请问你知道从哪里可以找到barcode和引物的fa文件吗??

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1 个回答

microRNA

barcode    是特定的,测序建库时用什么barcode, 分析时就得用什么barcode。 

1. 如果你对数据是测序公司提供的,他们应该会提供barcode序列给你。

2. 当然你也可以通过samtools 打开测序的文件(bam格式),比较一下序列,发现TTTTTTTTTTTTTTT附近多次出现的序列就是barcode 。

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