老师，您好，我们是做忙果基因家族分析的，用的是linux（用拟南芥的数据我们都能做出结果），但忙果注释文件gff总是报错，对我们学农的来说，对脚本真是一窍不通啊，根本不知道该怎么修改，老师叫我们把gff文件改成拟南芥的格式，用linux做，我们的基因id，mRNAid，蛋白id都是不一样的，我们想都改成与基因id一致的，我该怎么改啊，老师可以帮忙看看文件吗

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2 个回答

omicsgene - 生物信息 2023-04-11 07:58

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

尝试自己提取序列试试：https://www.omicsclass.com/article/2032

baby U 2023-04-11 09:56

agat_sp_filter_feature_by_attribute_value.pl  那四个脚本我这边都显示没有，上哪里找这个脚本呢，老师，您看，这是忙果的gff文件，（整个都好乱）[纠结]