再次进入容器时是卡主的。log中每小时更新一条信息,均为84% completed,tmp文件夹中不再更新文件。独享服务器(内存300G,28线程),设置了cpu=10,线程数=10
有些数据库不需要的话可以不用注释:
用这个参数指定: -appl CDD,COILS,Gene3D,HAMAP,MobiDBLite,PANTHER,Pfam,PIRSF,PRINTS,PROSITEPATTERNS,PROSITEPROFILES,SFLD,SMART,SUPERFAMILY,TIGRFAM
interproscan.sh -i interproscan.pep.fa \
-b interproscan.out -f "TSV" \
-cpu 48 -dp -t p -pa -goterms -iprlookup \
-T ./tmp -appl CDD,COILS,Gene3D,HAMAP,MobiDBLite,PANTHER,Pfam,PIRSF,PRINTS,PROSITEPATTERNS,PROSITEPROFILES,SFLD,SMART,SUPERFAMILY
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