老师好，我有个问题，不同物种之间同源蛋白序列进行多序列比对时，是用保守结构域进行比对比较好，还是用全部序列比较好？因为很多序列是从NCBI上下的，不能保证其序列的完整性。而且出来的比对图非常长，不好往文章里放。如果用这些可能不完整序列进行系统进化树的构建，是不是也会有影响？
构建基因的序列进化树，可以用基因的全长，也可以用基因的保守结构域，基因序列差异太大，建议用保守结构域构建进化树。
如果觉得我的回答对您有用，请随意打赏。你的支持将鼓励我继续创作！
