老师您好,我想用真菌线粒体基因组做群体遗传分析,已经组装好线粒体基因组,是需要把每个菌株自身的线粒体基因组当做ref还是用一个统一的线粒体基因组做ref?同时想请教也是按照重测序课程一个一个从线粒体基因组利用reads筛选snp么?

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omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

如果要得到SNP,对于基因组可以用基于参考基因组的方法做SNP变异

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