run_pipeline.pl -Xmx30G -SortGenotypeFilePlugin -inputFile clean.vcf.gz \ -outputFile clean.sorted.vcf.gz -fileType VCF
样本ID不能超过10个字符,你仔细检查一下,简化自己的样本ID;
如果超过10个字符会自动截断到10个字符,可能导致ID重复,你打开phy文件看看吧
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