15 老师好，我购买了咱们的群体研究，请问如何计算vcf文件中某段范围内的纯合基因型（GT）频率？
最佳答案 2023-07-20 09:47
我目前的计算思路是，提取这个范围内的SNP位点，然后对范围内的0/0 和1/1的出现次数进行计数求和，之后除所有基因型出现的次数，不知道这么计算对不对，还有一个问题就是计算是否要算上缺失的位点
我目前的计算思路是，提取这个范围内的SNP位点，然后对范围内的0/0 和1/1的出现次数进行计数求和，之后除所有基因型出现的次数，不知道这么计算对不对，还有一个问题就是计算是否要算上缺失的位点
