10 做真菌有参转录组测序,mapping值很低。

mapping值最高30最低25,并且物种分布结果中也有其他物种,有几种水平较高,但与样本均为一个属。那出现这样的情况是什么原因呢?之前这株菌在两三年前也已经做过鉴定了,所给的参考序列就是这个物种的,之前在板上的表现也是单菌落,在后续的操作过程中呢也始终保持无菌操作,那为什么会出现这么离谱的情况呢

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1 个回答

生信老顽童

和参考基因组比对率低,那大概率是菌株污染了。你可以自己查一下样品

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  • 孩提已过忆 提出于 2023-08-01 16:35

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