kmer分析与最后组装基因组大小不同

用kmer分析,gce以及genomescope软件评估基因组大小为900m左右,但是我用hifiasm组装和用canu组装去冗余后基因组大小只有760m左右,想问一下后面该怎么做呢,这种情况正常吗。

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

kmer评估有误差,你检查是否评估错了;

组装看看去冗余是不是去多了;

真正想知道基因组大小建议做流式细胞;

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  • 幻影 提出于 2023-08-12 20:31

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