quickmerge合并多个软件组装的基因组后,使用nextpolish去polish基因组,得到的结果的N50比打磨前的低是正常的吗?基因组由549M打磨到了531M,总的contig条数没变,N50都是N=3.

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

这个长度合并前后变化还没有关注过,变少了有可能哪里有问题,

你再检查检查数据的;看看合并之前两个组装结果的序列长度,然后再看看合并后的序列长度;


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  • 单恋一枝花 提出于 2023-09-17 13:16

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