mapping rates 有的样品值在60左右,请问老师如何把没有比对的reads进行blast?来判断没有比对上的reads是什么?
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怀疑数据有污染一般会随机选一些序列比对Nr库,看下序列比对到哪些物种及比例来判断。
谢谢老师解答,让公司随机选了比对了,接近一半多是目标物种,大概有30多显示unkonwn,这是什么原因呢?是不是可以解读不知道没有比对上的reads是什么?
谢谢老师解答,让公司随机选了比对了,接近一半多是目标物种,大概有30多显示unkonwn,这是什么原因呢?是不是可以解读不知道没有比对上的reads是什么?