如果不进行过滤，一些污染的没有比对到基因组的那些片段，会不会造成snp的假阳性，有可能不是我们目标物种的snp? 样品污染可能导致重测序mapping rate 值较低的话，这种数据还可以进行gwas分析吗？发文编辑会不会质疑数据的可靠性？
不用过滤，污染的reads不会比对到参考基因组，不会影响用于call SNP，也就不会影响call SNP的结果；
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