输入agat_sp_filter_feature_by_attribute_value.pl --gff  $gff --attribute biotype --value protein_coding -t '!' -o $species.protein_coding.gff3

以及agat_sp_keep_longest_isoform.pl --gff $species.protein_coding.gff3 -o $species.longest_isoform.gff3

这两个命令后总是报错bash: agat_sp_keep_longest_isoform.pl: command not found

无法继续进行