10 保留蛋白编码gff
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#保留蛋白编码基因
agat_sp_filter_feature_by_attribute_value.pl --gff $gff --attribute biotype --value protein_coding -t '!' -o $species.protein_coding.gff3
请问老师为什么运行这个命令的时候保留的gff文件里是biotype=rRNA/tRNA这些非编码基因（第一个图），而discard的却是protein_coding（第二个图）
刚刚测试过没问题的，你自己搞错了吧；