每当到了绘图步骤的时候，就会报错，报错原因是：pi_manhattan_plot.rcommand not found…我做了不同的分析，发现只要调用.r结尾的软件，绘图之类的就会报错，尝试设置了scriptdir 和export PATH，仍旧报错
看看这个同样的问题：https://www.omicsclass.com/question/4971 加下可执行权限，那些脚本
cd $scriptdir && chmod a+x *
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