dadi 分析中根据基因组创建annovar库出现报错

[root@30b37d57431e  00:02:31 /work/3.map/dadi]# gtfToGenePred -genePredExt /work/ref/Bamboo.Hic.gtf  unknown_refGene.txt

conflicting frame for PH02Gene38416.t1 exon index 0, was 0, trying to assign 2


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2 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

基因组文件格式问题,你需要看看这个基因是否有异常;

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红红火火

看不出出来有没有异常,我能不能直接把这基因删掉


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  • 红红火火 提出于 2023-11-03 00:17

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