老师，请教一下下载的参考基因组染色体名字不一样，有什么办法改成一致的名字嘛？比如chr1改成DD_shr1

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1 个回答

omicsgene - 生物信息 2023-11-06 12:07

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

用sed 搜索替换一下就可以；

例如：

sed -e "s/chr1/DD_chr1/" -e "s/chr2/DD_chr2/"  -e "s/chr3/DD_chr3/"  genome.fa >geneome.new.fa