5 core_pan_gene_curve.r 运行时报错

动植物泛基因组分析:03.gene_family_pav
分析自己的数据时,运行命令Rscript $scriptsdir/core_pan_gene_curve.r -i Orthogroups_PAV.tsv   --prefix core_pan_curve 出现以下报错信息

attachments-2023-11-Nfd4Uzex654786e8ac186.png

运行终止后,生成的结果文件如下

attachments-2023-11-EkcnqQhD6547884b78e3a.png

尝试从demo数据中cp Orthogroups_PAV.tsv,再运行上述命令,则可以顺利生成所有结果。

这是为什么呢?请老师帮忙解答一下

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2 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

你的输入文件和示例文件再对比对比看看有啥异常没有;

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白羽

你好,请问一下您是怎么解决这个问题


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