5 isoseq3使用问题

 您好,我看了您发布的《pacbio 三代全长转录组数据分析流程 Iso-Seq 3》的文章,另外我在github 上也看了isoseq3的流程,发现您的文章中没有isoseq3 refine 这个步骤。不过虽然github上有这个步骤,但是isoseq3 中并没有refine 这个工具(我是通过conda install -c bioconda isoseq3 这个指令来安装的)。这个感觉是官方的漏洞?我看了这个软件的工作流程,refine 实现了将转录本间连接物去除的功能。请问,没有refine 这步会影响最后的结果吗?



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1 个回答

microRNA

这个功能是最近在3.1版中更新的。影响应该不大。
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  • 拉古达 提出于 2018-12-05 10:38