做群体遗传分析,需要把indel提取出来嘛只用SNP的vcf文件?

公司给的是filtered_snp.vcf.gz和 filtered_indel.vcf.gz,我是不是应该合并起来再进行vcftools过滤后,进行群体分析?

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

群体分析用SNP就行了,indel用的少

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