vcftools --gzvcf all.varFilter.vcf.gz --recode --recode-IN.............els |gzip - > clean.vcf.gz这一步输出的vcf.gz文件,用 bcftools query -l clean.vcf.gz | wc -l查看样本名出现报错

Failed to read from clean.vcf.gz: unknown file type

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这是为什么呢
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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

没用过这个命令,你查查bcftools的帮助吧

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  • 红红火火 提出于 2023-12-12 15:41

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