vcftools --gzvcf all.varFilter.vcf.gz --recode --recode-IN.............els |gzip - > clean.vcf.gz这一步输出的vcf.gz文件，用 bcftools query -l clean.vcf.gz | wc -l查看样本名出现报错 - 组学大讲堂问答社区

vcftools --gzvcf all.varFilter.vcf.gz --recode --recode-IN.............els |gzip - > clean.vcf.gz这一步输出的vcf.gz文件，用 bcftools query -l clean.vcf.gz | wc -l查看样本名出现报错

Failed to read from clean.vcf.gz: unknown file type

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omicsgene - 生物信息 2023-12-12 17:13

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

没用过这个命令，你查查bcftools的帮助吧

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红红火火提出于 2023-12-12 15:41