annovar注释疑惑

为什么在视频教程中,结果输出两个snp.refGene.fa和snp.unknown_multianno.txt,自己跑程序的时候则生成了snp.refGene.exonic_variant_function.orig、snp.refGene.variant_function、snp.refGene.log。同时,会出现外显子格式不正确或者是输出文件格式不正常等报错信息,snp.refGene.fa和snp.unknown_multianno.txt则是0KB

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

你的GFF里面有些基因注释可能有问题,需要测试检查才行;看看 log文件中有啥提示没有

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