perl mutmap/mutmap.pl -vcf data/mutmapDemo.vcf -parent P -bulk Bulk -key Demo -od mutmapOut -win 2000000 -step 100000 -minCount 5 -ems
老师,以上是组学大讲堂里关于 mutmap 分析的命令,我看了 mutmap.pl 脚本里没有 --min-SNPindex 参数,我看好多文献都说,进行 mutmap 分析的时候,最好去除 SNP-index 值小于 0.3 的数据,如何在脚本里加入 --min-SNPindex 参数呢?非常期待您的回复,万分感谢!