建立索引

建立索引要完成这段代码这个命令需要配置什么？echo "build ANNOVAR index"

echo "RUN CMD: gtfToGenePred -genePredExt $gtf unknown_refGene.txt"

gtfToGenePred -genePredExt $gtf unknown_refGene.txt

echo "RUN CMD: retrieve_seq_from_fasta.pl --format refGene --seqfile $fa unknown_refGene.txt --out unknown_refGeneMrna.fa"

retrieve_seq_from_fasta.pl --format refGene --seqfile $fa --outfile unknown_refGeneMrna.fa unknown_refGene.txt

默认排序时间排序

1 个回答

Jay 2024-01-12 08:57

已解决。