GWAS假阴性过高,请问怎么解决

用tassel MLM模型绘制QQ图发现分析的结果假阴性,绘制曼哈顿图发现,没有点能够超过阈值,请问如何调整数据或前期分析的参数?
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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

1.检测模型的power不够,可以换blink farmCPU重新分析试试

2.位点本身由微效位点控制,样本数量不够检测效能不够,可以增加样本量

3.样本没有群体结构矫正过头,可以去除群体结构矫正


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