snp密度图绘制

注释后生成的snp.unknown_multianno.vcf文件绘制时有报错信息,Error in scan(file = file, what = what, sep = sep, quote = quote, dec = dec,  : 

  line 46 did not have 209 elements

Calls: read.table -> scan,应该是生成的vcf格式有问题,但是用一开始过滤完的snp.clean.vcf.gz绘制图片则正常输出,请问老师,这样得出的结果是一样的吗?可以这样吗?

请先 登录 后评论

1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

看看46行有没有异常:检查是否有单引号或者双引号,如果有可能导致R读取报错;

请先 登录 后评论
  • 1 关注
  • 0 收藏,833 浏览
  • shidandan 提出于 2024-01-13 15:31

相似问题