在做GWAS关联分析，利用gapit软件报错

Error in file(filename, "r", encoding = encoding) :

cannot open the connection

Calls: source -> file

In addition: Warning message:

In file(filename, "r", encoding = encoding) :

cannot open file '/biosoft/GAPIT3.0/gapit_functions.txt': No such file or directory

Execution halted

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3 个回答

马杰宇 2024-01-18 17:31

/biosoft/GAPIT3.0/gapit_functions.txt我找到了这个路径，发现没有这个文件，包括emma.txt，FarmCPU_functions.txt都没有

omicsgene - 生物信息 2024-01-19 09:43

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

用的是我们的docker镜像吗？如果是看看镜像是不是用错了

Changing 2024-01-28 18:12

请问同学， cannot open file '/biosoft/GAPIT3.0/gapit_functions.txt': No such file or directory Execution halted这个问题后来时如何解决的呢？我也遇到了同样的问题