GeMoMa报错

我从NCBI上下的基因组序列fa文件和gff文件,在运行时报错java.lang.IllegalArgumentException: You selected cdsParts=true, but the ID (gene-si:)seems to be no CDS part.Exception in thread "main" java.lang.RuntimeException: Did not finish as intended. java.lang.IllegalArgumentException: You selected cdsParts=true, but the ID (gene-si:)seems to be no CDS part.   应该如何解决呢

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2 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

GFF格式不标准吧;信息太少不好回答你的问题;


不建议NCBI上的基因组分析,格式不标准很可能导致报错;

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suj

改用ensembl数据库数据了,但是最后还是报错,没有生成final_annotation.gff。在08.GeMoMa.sh.o也没有找到报错信息08.GeMoMa.sh.o

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