我现在有公共数据库其中500＋种子，自己测了这种品种的一些表型，要做GWAS分析的话，请问老师，是通过下载fastq文件，自己组装拼接，然后比对到参考基因组上，然后获得这500个品种的VCF文件，然后进行GWAS分析吗？ - 组学大讲堂问答社区

10 我现在有公共数据库其中500＋种子，自己测了这种品种的一些表型，要做GWAS分析的话，请问老师，是通过下载fastq文件，自己组装拼接，然后比对到参考基因组上，然后获得这500个品种的VCF文件，然后进行GWAS分析吗？

回答问题即可获得 10 经验值，回答被采纳后即可获得 15 金币。

0 条评论
分类：GWAS

默认排序时间排序

1 个回答

omicsgene - 生物信息 2024-01-28 15:06

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

需要自己下载对应种子的fastq文件，不用组装拼接，比对基因组上就行；之后得到vcf文件就可以做GWAS了：

推荐课程：https://bdtcd.xetslk.com/s/RCGWQ

1 关注
0 收藏，1159 浏览
周游提出于 2024-01-28 11:27