提取CDS序列失败！！! - 组学大讲堂问答社区

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图1：我的基因组fasta序列；图2：longest_isoform.gff3文件；图三：运行报错；出来的CDS文件是空的。我是用的omicsclass/gene-family:v2.0。请问老师，这是情况该怎么解决呢?

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1 个回答

omicsgene - 生物信息 2024-01-28 20:34

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

还有GFF格式问题，这里的逗号和双引号应该删除，你对比课程里面正常的GFF文件格式；

看看是不是内存不够：https://www.omicsclass.com/question/6544