manifest已经是拼接好的如何设置?

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

拼接好的数据,可以作为单端输入,准备se-33-manifest

sample-id     absolute-filepath
sample-1      $PWD/some/filepath/sample1_R1.fastq
sample-2      $PWD/some/filepath/sample2_R1.fastq


导入命令:


qiimetoolsimport\
--type'SampleData[SequencesWithQuality]'\
--input-pathse-33-manifest\
--output-pathsingle-end-demux.qza\
--input-formatSingleEndFastqManifestPhred33V2


参考:https://docs.qiime2.org/2024.2/tutorials/importing/

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