有参转录组分析

Delimiter: "\t"

chr (19): #query, seed_ortholog, eggNOG_OGs, max_annot_lvl, COG_category, De...

dbl  (2): evalue, score


ℹ Use `spec()` to retrieve the full column specification for this data.

ℹ Specify the column types or set `show_col_types = FALSE` to quiet this message.

Error in file(file, "rt") : cannot open the connection

Calls: read.table -> file

In addition: Warning message:

In file(file, "rt") :

  cannot open file 'NA/pathway2name.tsv': No such file or directory

Execution halted

报错信息提示:找到不到那个表格,请问老师这是哪里出现了问题?这个输入的代码:Rscript  $scriptdir/eggNOG/eggnog_stat.r -o Plu.eggnog --emapper_anno .emapper.annotations -f Plu.gene.pep.fasta --keep.Pathway $scriptdir/eggNOG/pathways_plant.txt
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1 个回答

shidandan

对了 ,老师,请问昆虫的可以用哪一个?是用pathways_animal.txt吗?

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  • shidandan 提出于 2024-03-01 10:33

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