老师，在做共线性分析的时候，在gff文件中提取出来的基因位置信息和ID号，与蛋白质文件中的ID号不一致，一个为基因号，一个貌似为转录本的号，所以提不出来蛋白序列，这种情况应该怎么办呢？并且有些基因在哪条染色体上也没有研究清楚好像，所以提出来的有些基因的染色体号为0，那如果这样的话还可以往下做共线性分析吗