水稻LD的衰减距离如何计算?

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这是我用水稻中两个亚群作的图,怎么如此奇怪,如果放在文章中如何描述,这个衰减距离是多少?我看别人文献中关于水稻的衰减距离r²将到一半时定为衰减距离,一般都是100-200kb,而我这个降到一半是0kb是什么情况啊

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

过滤SNP的时候应该过滤一下SNP cluster;你这个应该是么有过滤导致的,你可以在绘图的时候把距离太近的值去掉再做这个图;

这些在我们重测序课程和遗传进化课程里面都有讲解:https://bdtcd.xetslk.com/s/RCGWQ




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