可以计算IBS:
#plink 方法 :plink IBS 方法检测离群样本:https://zzz.bwh.harvard.edu/plink/strat.shtml#outlier
plink --vcf all.clean.vcf.gz --cluster --neighbour 1 5 --allow-extra-chr -out outlier_ibs --mds-plot 4
IBD计算不清楚
可以计算IBS:
#plink 方法 :plink IBS 方法检测离群样本:https://zzz.bwh.harvard.edu/plink/strat.shtml#outlier
plink --vcf all.clean.vcf.gz --cluster --neighbour 1 5 --allow-extra-chr -out outlier_ibs --mds-plot 4
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