tassel跑glm模型报错et.maizegenetics.pipeline.TasselPipeline - TasselPipeline: parseArgs: expecting argument beginning with dash: importGuess

用这个命令跑run_pipeline.pl -Xmx30G -fork1 -h /mnt/data/lj/tassel1/hapmap.hmp.txt -fork2 importGuess /mnt/data/lj/tassel1/trit.txt -combine3 -input1 -input2 -intersect -FixedEffectLMPlugin -endPlugin -export hd_GLM报错说我的importGuess开始不是with dash？

dash到底是个啥东西啊啊啊啊啊啊啊啊？vcf转phy报这个错，现在怎么连表型都报这个错呀，郁闷

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omicsgene - 生物信息 2024-04-19 18:01

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

可能是你的软件安装问题吧，可以拿我们的测试数据测试一下软件；

建议你你用我们的docker镜像吧，我们的软件安装都测试过的；

再就是看看文件有没有异常吧；

tassel跑glm模型报错et.maizegenetics.pipeline.TasselPipeline - TasselPipeline: parseArgs: expecting argument beginning with dash: importGuess

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