LDdecay衰减距离如何确定？

老师好！请问做出衰减图之后，如何确定某一群体的衰减距离？r2不知道该取多大，且对应的值是怎么算出来的，从图片并不能知道具体的值。然后图特别不平滑可能是什么原因呢？这么不平湖，用bin作图也改善不了什么

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1 个回答

omicsgene - 生物信息 2024-04-22 09:14

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

LD衰减距离是R2最大值与最小值中间的值对应的距离就是平均衰减距离；课程里面有讲的：https://bdtcd.xetslk.com/s/3QzQFb

不平滑和你的群体数据有关系，个体差异数量等；