老师好,我在CALLSNP变异过滤时报错有几万行相同的错误。

这是我的命令

vcfutils.pl varFilter -w 5 -W 10 "gzip -dc all.raw.gatked.vcf.gz|" |gzip - >all.varFilter.vcf.gz

这是我的报错

Argument "." isn't numeric in multiplication (*) at /share/work/biosoft/bcftools/latest/bin/vcfutils.pl line 323, <> line 167.

请先 登录 后评论

2 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

你用的是我们的docker镜像分析数据吗?如果不是可能由于系统版本软件版本包错;

请先 登录 后评论
Marina

3k下载的bed转vcf后,出现了同样的报错Argument "." isn't numeric in multiplication (*) at /share/work/biosoft/bcftools/latest/bin/vcfutils.pl line 323

请先 登录 后评论