cafe5 Families with largest size 删掉这些基因家族后跑的非常慢

请问老师删掉这些基因家族后cafe5运行的非常慢是为什么?以前没有这个报错的时候运行base和gamma模型都非常快,这一次出现这个报错,我按照脚本删掉了差异大的家族,然后跑了2天了还没结果.

另外,删掉这些基因家族后是重新运行base和-k2~-k5还是只运行-k3就行了?

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

如果太慢多给些线程--cores ; -k 值自己选择吧,不比较 运行到k 3 也可以;

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