VCF注释

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attachments-2024-05-VIAaomXV66458037697a4.png在对VCF进行注释时报错格式错误,打开相应文件请问老师这里需要怎么修改?

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2 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

如果是用的是我们提供的镜像,那你这个vcf文件对应位置的SNP可能有问题,或者基因组上这个位置碱基是不是杂合的,你检查一下;

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Jay

代码运行只生成了图中文件,我截取了VFC和基因组该位点的信息麻烦老师帮忙看一下。attachments-2024-05-hr817TNc6645d2541e8e2.pngattachments-2024-05-FQab29RW6645d25a6a7ef.pngattachments-2024-05-jBfBy0Yp6645d26018d02.png

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