差异条件太严格,没找到结果;看看这个换个检验方法,比如 wilcox 并降低阈值试试
看看这个问题:https://www.omicsclass.com/question/6550/answer/5968
执行此代码:Rscript $scripts/seurat_FindMarkers.r --rds $workdir/05.cell_type_ann/pbmc.added.celltype.rds \
-p FindMarkers.deg.B --group.by "stim" --ident.1 "stim" --ident.2 "ctrl" --subset.ident "B" \
--test.use DESeq2 --logfc.threshold 0.25