在用gemma分析gwas时,调用perl脚本中的sort_trait.pl,发生报错,请老师帮忙解答,谢谢老师。

perl $scriptdir/sort_trait.pl snp_var.fam \$workdir/05.trait/Thousand_Grain_Weight_2020.txt  |cut -d " " -f 1-5,7 >snp_var.fam1

mv -f snp_var.fam1 snp_var.fam


readline() on closed filehandle IN at /home/sdl/trial/5.23gwas/scripts/sort_trait.pl line 11.

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

输入文件路径检查一下,文件路径写错了,文件不存在;

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