for i in  goods_coverage  observed_species PD_whole_tree  shannon simpson;do

       alpha_compare_stat.r -i alpha_div_index.txt --index $i \

            --group Group -f $fastmap -o alpha_diversity_stat

        alpha_compare_plot.r -i alpha_div_index.txt -I $i -f $fastmap   \

            -g Group -G boxplot jitter -o alpha_diversity_stat --name "${i}_Group_boxplot"

done

我只有一个分组Group，元数据文件也没有问题