使用run_pipeline.pl将vcf.gz文件转换为.phy文件后运行该命令,出现报错,报错内容如下图:
请问这是什么原因呢?是测序公司返给我的vcf.gz文件有问题还是我的命令有问题?
转换的phy文件打开看一下,这里DNA的核酸编码:https://www.omicsclass.com/article/409,是不是还有其他字符?
检查一下;
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