bandage中节点的深度

问题一:在bandage中节点的深度有500X,但实际上我的测序数据只有30X,为什么bandage中和实际的深度是不同的呢?

问题二:在bandage中,不同节点的测序深度差别很大,最低的深度有500X,最高的深度有5000X,请问是什么原因造成了这种情况呢?

请先 登录 后评论

1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

你的30X测序只是平均测序深度,实际测序并不均匀,一般基因组上有重复区域重复越多深度会很高;

请先 登录 后评论
  • 1 关注
  • 0 收藏,564 浏览
  • 仰望天空 提出于 2024-07-08 17:48

相似问题