猪单细胞测序数据进行轨迹分析时,已经知道分化的起源,想请教老师这个代码应该怎么修改?Rscript $scripts/cell_trajectory_monocle2.r -g mycelltype \
-i subset.T.rds -p monocle2 \
--order.gene.select.method monocle --heatmap.gene 20 \
--heatmap.clusters 4
默认是不能设置起源的,需要手动设置;
最近单细胞课程会更新,使用monocle3分析数据;
或者你使用RNA速率分析细胞发育;
如果觉得我的回答对您有用,请随意打赏。你的支持将鼓励我继续创作!